С помощью саратовских ученых расшифрован геном хламидии

Саратовские ученые приняли участие в исследовании, по результатам которого удалось оцифровать и расшифровать геном возбудителя хламидиоза - бактерий Chlamydia trachomatis. Об этом пишет "Индикатор" со ссылкой на серию статей, опубликованную в журнале Progress in Biomedical Optics and Imaging, Proceedings of SPIE и Frontiers in Bioscience. 

Сейчас записи последовательностей ДНК хранятся в огромных текстовых файлах, что неудобно для анализа. Существует технология оцифровки, которая позволяет представить эти данные в виде своеобразной тепловой карты. 

Профессор Саратовского госуниверситета Сергей Ульянов разработал алгоритм, работающий не на традиционном двоичном, а на четырехзначном коде. С его помощью ученые из Федерального исследовательского центра вирусологии и микробиологии вместе с коллегами из Саратова смогли оцифровать гены возбудителей болезней, общих для животных и человека, причем не только бактерий, но и вирусов, в частности птичьего гриппа, указывает издание. 

Проект был поддержан грантом Российского научного фонда. Для повышения чувствительности метода ученые изменили технологию, добавив наночастицы золота. Это позволило им обнаружить единственную клетку хламидии в тестовом образце.

"Сейчас насчитывают 17 видов хламидий и сотни различных вариантов возбудителя хламидиоза. Наш подход, выявляющий минимальные генетические различия в них, позволит не только ставить верный диагноз, но и понимать, какие меры стоит принимать. Терапия будет определяться тем, каким штаммом заразился пациент, кошачьим или человеческим", - приведены слова научного сотрудника СГУ Валентины Федоровой.

Впервые расшифрованный геном изолированного в России возбудителя хламидиоза загрузили в базу данных генетической информации GenBank. Открытие поможет значительно улучшить методы мобильной диагностики заболевания.